Devido a situação de guerra que assolou o País, o AH Gove foi objecto de duas sabotagens, uma em Agosto de 1986 e a outra em Fevereiro de 1990. Destas sabotagens resultaram os seguintes estragos principais:
- Destruição e obstrução da entrada da Galeria de acesso da margem esquerda à galeria longitudinal.
- Danificação do poço de acesso à câmara de comportas.
- Destruição do equipamento hidromecânico do poço de acesso à descarga de fundo e de todo o
equipamento de injecção, para consolidação do corpo da barragem e impermeabilização da fundação.
- Danificação da plataforma e do pórtico instalado à cota 1595 que se destinava ao apoio do sistema de comando das comportas planas.
- Danificação do coroamento e corpo da Barragem próximo do encontro esquerdo.
- Destruição das infra-estruturas de apoio à Barragem, nomeadamente a Pista da Aviação e Vila de Operadores.